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公元1206年，蒙古乞颜部首领铁木真统一草原，建立了大蒙古国，并自封为成吉思汗。蒙古国建立后，成吉思汗和其手下将士开始东征西讨，相继攻占西夏、金朝、花剌子模等国家。成吉思汗死后，其继承人窝阔台、贵由、蒙哥等也继续延续征服之路，先后灭掉40多个国家，最终建立了面积达3300多万平方公里、横跨亚欧大陆的超级帝国。

然好景不长，蒙哥死后，其弟忽必烈和阿里不哥为争夺汗位大打出手。虽然这场内战以阿里不哥战败投降结束，但统一的蒙古帝国也逐渐分裂为元朝和四大汗国（钦察汗国、察合台汗国、窝阔台汗国、伊利汗国）。

其中，察合台汗国是由成吉思汗次子察合台建立，疆域大约包括今新疆及中亚地区。察合台死后，因为各方势力的斗争，在继承人问题上也是纷争不断。14世纪，分裂为东察合台汗国和西察合台汗国。公元1362年，突厥化的蒙古贵族帖木儿起兵反叛，相继降伏东、西察合台汗国后建立了帖木儿帝国。帖木儿本人雄心勃勃，颇有恢复成吉思汗时期蒙古荣耀的志向，建立帝国后不断扩张领土，先后与波斯、金帐汗国、奥斯曼帝国等交战，最终形成东起北印度，西达小亚细亚，南濒阿拉伯海和波斯湾，北抵里海、咸海的大帝国。

公元1404年，帖木儿率领20万大军来到哈萨克斯坦，准备从这里进军新疆，继而进攻中国明朝。不巧的是，就在次年，帖木儿突发疟疾而死，东征计划被迫流产。帖木儿的死，让帝国又陷入了内乱之中，他的儿子们为了争夺汗位又继续开打。最后第四子沙哈鲁夺取苏丹之位。沙哈鲁死后，帖木儿帝国逐渐衰落。直到1500年，被中亚的乌兹别克游牧民族灭掉。

帝国虽然灭亡，帖木儿家族依然存息。帖木儿的六世孙巴布尔，经过多年在中亚的失败流亡之后，转而南下印度，剑指南亚次大陆。多年的流亡生涯，锻炼了巴布尔的战争才能，经过长达八年的征战，在1526年打败了统治印度320年的德里苏丹王朝，建立了莫卧儿帝国（“莫卧儿”波斯语是蒙古）。就这样，消逝于中亚的蒙古帝国余晖，又重新闪耀在了印度大陆。

1530年，47岁的巴布尔英年早逝，其后代继续南进，先后平定了南方几个王国，版图真正囊括了整个南亚次大陆。巴布尔之孙阿克巴在位时，为了巩固国家统治、防止地方割据，在中央设立宰相、财务等大臣加强中央集权，地方上划分了十五个省，并派驻总督、司法、财政等官员管理具体事务，剥夺了原来贵族王公的权力。同时重新丈量国家土地，改革税赋制度。为了缓和民族矛盾，阿克巴还对本地的统治阶级实行怀柔政策。宗教上也比较宽容，尊重宗教信仰自由。从此，莫卧儿帝国逐渐步入了黄金时代。

阿克巴的改革虽然使帝国走向了鼎盛，但并未解决根本问题，内部种姓制度依然存在，高官贵族们在统治区域内大肆兼并土地，横征暴敛。普通百姓依然生活在上层的压迫剥削之中，反抗运动迭起。外部中亚地区游牧民族虎视眈眈、侵扰不断。第六位皇帝奥朗则布死后，后续几任统治者都是昏庸之辈，莫卧儿帝国内部开始屡屡发生宫廷政变，各省的总督也趁机纷纷割据自立。

进入18世纪之后，世界格局发生变化，西方列强兴起。早在1600年，英国就成立了东印度公司，开始殖民印度。1764年10月，英属东印度公司和莫卧儿帝国在布克萨尔（今印度比哈尔省）地区进行了一场战役。英方7000余人兵力以少胜多击败了莫卧儿和孟加拉数万联军，莫卧儿皇帝沙阿兰姆亲自投降英国人。从此，莫卧儿皇帝正式沦为英国的傀儡。

公元1849年，英国吞并了旁遮普地区，莫卧儿帝国彻底成为英国的殖民地。1857年，印度人民爆发了反英起义，末代皇帝巴哈杜尔·沙二世为摆脱控制，也发文号召起义。同年9月，起义失败，巴哈杜尔皇帝向英国人投降后，被殖民当局流放至缅甸仰光，莫卧儿王朝正式灭亡。