cellranger count参数设置与结果解读
16天前写在开头 上期给大家整理了一下10x单细胞分析第一步：Cell Ranger下载+配置，这期就一起来看看怎么分析数据叭！ 需要下载的数据及软件主要有三个，在cellranger下载安装与配置有分享过下 …
annoSnake：一款用于宏基因组和MAGs的模块化、一站式自动化注释管道
17天前宏基因组 如果你正为宏基因组数据的组装和注释而忙于“拼工具、调环境、转格式”，那么annoSnake或许能让你从繁琐中解放。 它是一个基于Snakemake的自动化工作流程，从clean reads组 …
云南民族大学虫草生物多样性可持续利用研究团队从基因组水平评估虫草属物种潜在毒素化合物安全性
20天前该研究从基因组层面评估了虫草属物种中潜在毒素化合物的安全性。通过对虫草属18个菌株的全基因组进行测序与注释，将其基因组序列与该属其他6个菌株进行基本特征比较分析，进一步利用antiSMASH和本地BL …
nature communications｜香港地区大肠杆菌抗生素耐药性基因组标记的生态连通性
22天前抗生素耐药性大肠杆菌是构成全球抗生素耐药性负担的主要因素之一。尽管“One Health”强调人类、动物和环境健康的关联，但跨生态区系的微生物交换在基因组解析和定量整合分析方面仍待补充。2025年8月 …
简评DeepSeek 写的幽门螺杆菌（Hp)基因组介绍
1个月前编 者 按 前期我们讨论了幽门螺杆菌（Hp）耐药表型和基因型，可能大部分消化科或检验科同事并不完全了解幽门的基因组组成，近期DeepSeek大火，我试着让它写一个幽门基因组介绍。大家也看一下， …
生物学迎来「ChatGPT时刻」：Evo构建首个AI生成的「基因组」，开启生成式基因设计时代
2个月前将 ScienceAI 设为星标 第一时间掌握 新鲜的 AI for Science 资讯 编辑丨coisini 还记得 Evo 吗？ 2024 年，由 Arc 研究所（Arc Institute）、 …
Simple Genome Hub | 长时有效管理你喜欢用基因组版本和数据
3个月前写在前面 当前，越来越多物种基因组得到测序，甚至同一个物种我们都会得到非常多个基因组，当然也包括各种单倍型基因组云云。有时候我们可能会用这个基因组，有时候又要用那个基因组。总而言之，要是你稍微做一点点 …
零基础 | 一键HiMT细胞器基因组到进化树构建
3个月前写在前面 事实上，我们从来没想过要做细胞器基因组，更没有想到和唐总（在广州时团队的小伙伴）一起折腾了HiMT。显然，HiMT应该是从一定程度上缓解了“细胞器基因组组装焦虑”。我们主要解决了两个小问题： …
十年乙醇保存的样本，还能组装高质量基因组？！
4个月前物种高质量的基因组为理解系统发育关系、发现进化过程的基本原理，应用基因组方法来表征、监测和保护生物多样性，并最终揭示地球上迷人的生命多样性背后的遗传蓝图提供了强大的基础。因此，生成真核生物物种的高质量 …
汉族基因特别在哪？万年演化炼三绝：免疫力、寿命长与酒量有多牛
4个月前在东北一个山村里，90多岁的秦老爷子每天雷打不动喝半斤白酒，抽一袋旱烟，还能下地干活。村里人说他是“铁胃铜肝”，却不知这背后藏着汉族基因演化的神奇力量。 科学家通过基因组测序发现，像他这样的老人体内， …