Cancer cell | 空间与单细胞测序解析肺腺癌演进规律：肺泡祖细胞为早期起源，IL1B-IL1R1 轴驱动前体病变进展
12天前研究背景 肺腺癌（LUAD）的早期演进机制长期存在认知空白——前体病变（如 AAH、AIS）如何向浸润癌转化、是否存在更早的起源细胞、微环境在其中的作用，这些关键问题尚未明确，导致临床难以实现早期精准 …
CellWhisperer让聊天式分析成为现实；肿瘤亚克隆进化分析新工具；人类皮肤淋巴管“新地图”；新策略解析B细胞多样性 等
16天前1 AI助力单细胞探索革命：CellWhisperer让“聊天”式分析成为现实 ❝ 文章：Multimodal learning enables chat-based exploration of s …
单细胞免疫组库更新【3】：scRepertoire包TCR/BCR结合scRNA数据分析
28天前R版免疫组库分析scRepertoire包另外一个重要的分析就是结合scRNA与TCR/BCR数据，对VDJ数据从更多的角度解析。 1-构建单细胞seurat object及数据预处理 合并克隆信息与 …
基于Signac的scATAC-seq流程学习
1个月前在进行染色质数据的预处理时，Signac会使用来自CellRanger生成的两个相关的数据。 峰/细胞矩阵（Peak/Cell matrix）：这一矩阵类似于在单细胞RNA测序分析中使用的基因表达计数 …
肝脏单细胞注释：8亚群和t细胞在一起但不表达cd3和常见的maker可能是什么细胞？
2个月前曾老板在小红书上看到一个有意思的帖子发给了我，里面提到了一个单细胞数据的分析结果：「肝脏的单细胞分群注释的时候发现其中一个亚群8和t细胞在一起但不表达cd3和常见的maker，博主进行了求助问可能是什 …
Cellrank2演示教程：在多模态单细胞数据中的统一细胞命运推断
2个月前1-cellrank2简介 Cellrank是啥？ cellrank是一款基于多视角单细胞转录组数据（包括RNA速率、发育潜能、拟时序、系谱追踪数据、代谢标签等）用于研究例如发育、再生、癌症、重编程等 …
5+单细胞 + WGCNA + 分型，多组学整合 + 靶点筛选 + 模型构建的框架，小白们闭眼都能抄作业！
3个月前导语 结果： T 细胞相关基因表达谱的鉴定 根据GSE243347 包括 27 个样本的单细胞图谱，作者得出了包含 7,182 个细胞和 10,128 个特征的基因表达矩阵，以供进一步分析。使用 Ha …
“云端+智能”单细胞分析平台；新技术把磷酸化信号与转录组一起装进单细胞；冷冻肾脏精准“发声”；骨髓瘤检测新选择；小队列“说大话”
4个月前1 CytoAnalyst: 一站式“云端+智能”平台助力单细胞RNA测序分析 ❝ 文章：CytoAnalyst web platform facilitates comprehensive sing …
儿童睡眠呼吸暂停的单细胞测序研究完结篇
4个月前文章概述 文章标题：《Single-cell RNA-seq uncovers cellular heterogeneity and provides a signature for paediatr …
5+单细胞+机器学习，科研没头绪，不妨试试这个思路！
6个月前导语 结果： GBMAN 的四个主要亚群的组成 中性粒细胞是 GBM 中浸润程度较低的免疫细胞之一。为了全面了解 GBMAN 的景观，作者从九个数据集（图 S1 A-C）收集了原发性及复发性 ID …