成吉思汗铁木真四个嫡子中，要是按派系划分，则可以划分为术赤和拖雷一派，察合台与窝阔台一党。
如果没有察合台，窝阔台在铁木真死后当不了蒙古大汗。但是即便二人之间这么好的关系，窝阔台死后65年，他的窝阔台汗国还是被察合台汗国灭掉。
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所以，察合台家族和窝阔台家族在这不到百年的时间里，是如何从捆绑一起的盟友，变成互相攻伐的死敌的呢？
察合台对窝阔台的支持
公元1219年，在铁木真立蒙古帝国继承人时，察合台为了保全窝阔台当上大汗继承人，不惜以身入局，大骂铁木真的长子术赤是篾尔乞人的野种。最后成功将术赤拉下水，让窝阔台成了蒙古帝国的继承人。
公元1227年，在铁木真去世之后，窝阔台本应继承汗位，但幼弟拖雷仗着自己幼子的身份，按照蒙古传统，继承了铁木真生前大部分的封地，属民和军队。
有了铁木真遗产的加持，拖雷根本就没将窝阔台这个蒙古大汗的继承人放在眼里，而是自己当了蒙古帝国的监国。
而这一当就是两年之久。
在这两年的时间里，由于窝阔台势力弱小，他尝试了各种办法，却始终没有从拖雷那里夺回权力。
公元1229年，在拖雷监国两年之后，察合台看不过去了。
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于是察合台联系了铁木真生前的心腹旧臣耶律楚才，以及铁木真的幼弟铁木哥，而后察合台说服他们集体向拖雷施压，这才让窝阔台当上了蒙古帝国的大汗。
得益于察合台的帮助，窝阔台在继位之后一直对察合台尊敬有加，国家大事，还时常和察合台商量。
而公窝阔台继位之后，察合台则是不再过问蒙古的军政大事，大部分时间都待在自己的封地察合台汗国，也就是今天中亚锡尔河与阿姆河之间的河中地区，以及新疆的喀什葛尔地区。
在铁木真的四个儿子中，除了察合台有自己的封地之外，铁木真还给术赤和窝阔台也分封了领地。
其中，术赤的领地在察合台汗国的北边，也就是咸海和里海北部的钦察草原；而窝阔台的封地，则是在阿尔泰山以西到巴尔喀什湖以东的新疆伊犁河谷地区。
在地理位置上，察合台的领地可以和窝阔台的领地不仅可以连成一片，同时他们还可以隔绝术赤领地与蒙古本土的联系，也就是隔绝术赤和拖雷的联系。
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所以，无论在铁木真去世之前，还是铁木真去世之后，察合台与窝阔台在对付术赤和拖雷的问题上，一直都是同气连枝。
由于察合台晚年是个闲散蒙古宗王，所以他便可以一直待在中亚地区的封地。而窝阔台因为蒙古帝国的大汗，所以他只能在蒙古帝国的都城哈拉和林坐镇。
于是，窝阔台在世之时，便把他的封地赐给了长子贵由。
公元1241年，察合台和窝阔台在这一年同时去世。由此，察合台家族和窝阔台家族的情谊，便转交到后人手中。
窝阔台家族的内斗
察合台生前最喜欢的儿子，是长子木阿秃干。但是木阿秃干却在公元1220年和铁木真攻打花剌子模时战死了。于是，察合台在去世之前，便将察合台汗国的大汗之位，传给了木阿秃干的儿子哈剌旭烈。
由此，哈剌旭烈成为察合台汗国的第二任大汗。
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而窝阔台生前最喜欢的儿子，是三子阔出。但是阔出却在公元1235年奉窝阔台之名攻打南宋时战死。于是，窝阔台在去世之前，指定阔出的儿子矢烈门继任蒙古帝国大汗。
然而，在窝阔台死后，他的皇后乃马真不喜欢孙子矢烈门，而是喜欢长子贵由。于是他便废掉了矢烈门的继承人资格，立了贵由为蒙古帝国的大汗。
公元1246年，在乃马真去世之后，贵由登上了蒙古帝国的大汗之位。而此时的贵由不仅是蒙古帝国的大汗，还是窝阔台汗国的大汗。
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贵由在登上汗位之后，由于痛恶自己父亲窝阔台不立儿子，选孙子当继承人行为。而后便以察合台的儿子还在为由，废了察合台孙子哈剌旭烈的察合台汗国大汗之位。
贵由在废了哈剌旭烈察合台汗国大汗之位后，他改立察合台的二儿子也速蒙哥为察合台汗国大汗。
贵由此时虽说是蒙古帝国的大汗，但是其此种做法，无疑是在伤害察合台系和窝阔台系的关系。因为哈剌旭烈的察合台汗国大汗之位，是察合台生前亲自指定了，人家想给谁就给谁，贵由横加干涉的这种行为是不正确的。
公元1246年秋天，在解决完察合台汗国的事情之后，贵由又带着兵马越过阿尔泰山，去攻打术赤儿子拔都建立的钦察汗国。
但是在前往钦察草原的路上，贵由却离奇暴毙。
贵由这一死，整个蒙古汗国和窝阔台汗国又群龙无首。
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由于贵由死的突然，生前又没有确立接班人。所以在贵由死后，他的两个儿子忽察和脑忽，以及窝阔台生前指定的接班人矢烈门，因为蒙古帝国大汗之位又争的头破血流。
由此，窝阔台家族在贵由死后，陷入到了内斗之中。
蒙哥对窝阔台家族和察合台家族的清洗
公元1249年，在窝阔台的三个孙子：忽察，脑忽，矢烈门为了大汗之位内斗两年之后，术赤的儿子拔都，邀请蒙古各大宗王前往钦察汗国商议蒙古帝国的大汗人选。
公元1251年，在拔都的支持下，拖雷的长子蒙哥当上了蒙古帝国的大汗之位。
但是对于蒙哥的继位，窝阔台家族和察合台家族却联合起来反对。
面对窝阔台家族和察合台家族的反对，蒙哥直接用上了武力镇压。
在蒙哥的武力镇压下，窝阔台家族的矢烈门被流放到中原汉地，忽察和脑忽二人被流放到朝鲜半岛的高丽王朝；贵由的皇后海迷失被扔进河里淹死。整个窝阔台家族的男性被杀了70多个，女性有三分之一被赐死。
自此，窝阔台家族的脊梁被打残。
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而相较于窝阔台家族，察合台家族受到的伤害也不小。蒙哥上位之后，由于察合台汗国的现任大汗也速蒙哥是窝阔台家的贵由扶持的。于是蒙哥迅速废掉了也速蒙哥的察合台汗国大汗之位，而后又将也速蒙哥秘密杀死。
在杀死也速蒙哥之后，蒙哥又让察合台的孙子哈剌旭烈重新当上了察合台汗国的大汗。但是哈剌旭烈还没来得及去察合台汗国上任，就在路上病死了。
哈剌旭烈在临死之前，又将察合台汗国的汗位传给了孙子木八剌沙。
而窝阔台家族那边，蒙哥也没有对他们赶尽杀绝，而是将窝阔台的一个孙子海都，封到了窝阔台汗国的伊犁河谷地区，让他去充当窝阔台汗国的门面。
窝阔台汗国与察合台汗国的争斗
公元1256年，海都在窝阔台汗国公然拘留了蒙哥派去的使者。
但是这时的蒙哥由于正在带兵攻打南宋，所以也就没能制裁海都。而在公元1259年，蒙古帝国的第四任大汗蒙哥又在攻打南宋的时候战死。
这蒙哥的去世，让海都复兴窝阔台家族的决心更加强烈。
蒙哥死后，他的两个弟弟忽必烈和阿里不哥相继称汗，而后为争夺汗位在蒙古高原大打出手。
这时，窝阔台汗国的海都和察合台汗国的木八剌沙都选择支持阿里不哥。
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但就在这时，在漠北称汗的阿里不哥却废除了木八剌沙的察合台汗国大汗之位，而后立察合台的孙子阿鲁忽为察合台汗国的大汗。
但是这个阿鲁忽在登上察合台汗国的大汗之位后，立马背叛了阿里不哥，转而投靠了忽必烈。
阿鲁忽的这种背叛行为，彻底惹怒了阿里不哥，而后阿里不哥便带兵去攻打察合台汗国的阿鲁忽。
而在阿里不哥攻打察合台汗国时，窝阔台汗国的海都却帮助阿里不哥一起攻打察合台汗国。
这样一来，窝阔台家族和察合台家族之间的联盟就彻底破裂。
在海都的帮助下，阿里不哥击败了阿鲁忽，阿鲁忽逃往中亚，而海都则是趁势扩大窝阔台汗国的势力。
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公元1264年，阿里不哥在和忽必烈的汗位争夺战中失败，忽必烈成为了蒙古帝国的大汗。而阿里不哥战败之后，阿鲁忽则是趁势回到察合台汗国，又一次当上了察合台汗国的大汗。
由于此前的海都帮助过阿里不哥攻打察合台汗国，又在忽必烈和阿里不哥争夺汗位时支持阿里不哥。
所以阿里不哥失败之后，海都便面临着来自忽必烈和阿鲁忽两边的压力。
为了缓解压力，海都又抱上了钦察汗国的大腿。
在钦察汗国的帮助下，窝阔台汗国的海都得以在中亚地区和察合台汗国的阿鲁忽分庭抗礼。
窝阔台汗国收服察合台汗国
公元1265年，察合台汗国的大汗阿鲁忽去世。
阿鲁忽去世之后，忽必烈任命察合台的曾孙八剌前往察合台汗国继任汗位。
由于八剌是忽必烈的心腹，所以他在察合台汗国掌权之后，很快就开始攻打窝阔台汗国的海都。
这样一来，双方就恶战了三年多。
但是，初到察合台汗国的八剌明显水平不行，在这三年时间里，被窝阔台汗国的海都胖揍了好几顿。
公元1269年，在经过三年时间的战争后，窝阔台汗国的海都打服了察合台汗国海都。
在海都的威逼利诱下，八剌最终和海都站在了一起，共同开始对付忽必烈。
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公元1270年，窝阔台汗国的海都和察合台汗国的八剌出兵八万去攻打忽必烈，但是却被忽必烈的儿子纳木罕击败。
公元1271年，察合台汗国的大汗八剌去世，临死之前他将察合台汗国的权力交给了窝阔台汗国的海都。而在八剌去世的当年，忽必烈在蒙古高原和中原地区建立了大元王朝。
八剌死后，窝阔台汗国的海都立了八剌的儿子都哇为察合台汗国大汗。
都哇继位之后，他则成了海都的傀儡，海都则是利用都哇控制了察合台汗国。
随后，海都、都哇二人带领着窝阔台汗国和察合台汗国的军队与忽必烈的大元王朝，进行了长达30年的战争。
公元1301年，窝阔台汗国的海都在67岁那年，带着都哇和元朝的军队在漠北展开了最后一次决战。
但战争却以海都的失败而告终。
察合台汗国与元朝瓜分窝阔台汗国
公元1301年冬，在返回窝阔台汗国的路上，海都病死于途。在临死之前，海都将窝阔台汗国托付给了察合台汗国的都哇。
但是都哇自从当上察合台汗国大汗之后，他一直受制于海都30多年。现在海都好不容易死了，都哇也想体验一把控制窝阔台汗国的滋味。
于是在海都死后，察合台汗国的都哇将海都最懦弱的儿子察八儿立为察合台汗国的大汗。
在察八儿当上窝阔台汗国的大汗之后，都哇又劝说他放弃和元朝的互相攻伐。随后，察合台汗国的都哇和窝阔台汗国的察八儿便承认了元朝的正统地位。
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但在这不久之后，察合台汗国的都哇就私自和大元王朝取得联系，并与其相约共同瓜窝阔台汗国。
随后，察合台汗国的都哇和大元王朝开始东西夹击窝阔台汗国。
公元1309年，在察合台汗国和大元王朝的东西夹击下，窝阔台汗国的察八儿战败，而后向元朝投降。
察八儿投降之后，窝阔台汗国的领地被察合台汗国和大元王朝瓜分。
自此，从窝阔台受封伊犁河谷地区算起，存在了84年的窝阔台汗国灭亡。而窝阔台至死也没料到，最后灭亡窝阔台汗国的，竟是他的好兄弟察合台的后人。