1913年，在民国的首届国会选举中，由于宋教仁主持，国民党大胜，在两院中占了绝对优势。第一次国会选举之后，宋教仁成为总理已成定局。袁世凯忧心忡忡地对杨度说：“我不怕国民党用暴力，我怕他们用合法手段来赢得政权。”袁世凯托人收买宋教仁，但宋教仁不为所动。袁世凯收买不成，就想花钱抹黑宋教仁，不想却发生了宋教仁被刺案。
应夔丞的刺杀谋划
却说进入民国后，风云变幻，大小人物各有浮沉，乱世之中艰难求生。
1913年3月14日，有卖字画的湖南人王阿法，到法租界应夔丞（字桂馨）家中兜售字画。应夔丞对字画并无兴趣，反而拿了一张照片给王阿法看，云：“欲杀此人，如能办到，愿酬大洋一千元。”王阿法一介书生，哪有杀人之胆，当即回绝，称自己无此能力，将照片交还。
想买凶杀人的应夔丞，背景极其复杂。他原是青帮大字辈头领，略通英语，开过戏院，贩过军火。辛亥革命后，孙文从海外回到上海，应夔丞负责照料，并组织卫队护送到南京，鞍前马后，奔走效力，成为孙文亲信。
孙文担任临时大总统后，应夔丞担任卫队长，后转任南京临时政府庶务科长。此后应夔丞因贪污伙食费而被开除，回到上海，继续混江湖。1912年7月1日，在陈其美扶持下，应夔丞联合青帮、洪帮、哥老会三大帮派，组织中华国民共进会，担任会长。共进会多为黑帮分子，在各地不断滋事，敲诈勒索，开堂设赌，一度应夔丞还被政府通缉。
主犯应夔丞
因为共进会屡屡滋事，袁世凯很是恼火，严令解散。此后袁世凯亲信洪述祖，将应夔丞收编，不但取消了通缉令，且拿到了编制，担任江苏驻沪巡查长，每月发给经费，侦察“匪踪、匪巢及匪党一切秘密不正行为”。借解散共进会之名，应夔丞与洪述祖二人，联手骗了袁世凯五万元大洋作为活动经费，却又没办成事。
此年应夔丞、洪述祖想要再骗一笔钱，为此要干一次大行动，四处寻凶杀人。
1913年3月21日，应夔丞向洪述祖报告刺宋任务已完成密电。
却说山西人武士英，面目凶恶，身材短小，有些手脚功夫，辛亥革命时任云南七十四标二营管带，因蛮横不羁、作风败坏被遣散，流落上海讨生活。在沪上，武士英贩卖花瓶，生意萧索，时常向人借钱，不想突遇贵人，得了意外之财。
约在3月12日前后，武士英在茶楼吹牛时，结识了共进会中人陈玉生，此人操镇江口音，二人一见如故。陈玉生请武士英喝酒时道：“现在我们要办（杀）一人，这人与中国前途有非常关系。这人是无政府党，吾等将替四万万同胞除害。”武士英也是酒精上头，当即答应帮忙杀人。
陈玉生闻言大喜，即替武士英在五马路六野旅馆开了一间房。陈玉生又带了武士英，一起至法租界文元坊北弄二号应夔丞住处，通过请客嫖妓、交换金兰谱，给他打气。此期间武士英还加入了共进会，颇有遇上贵人，前途一片光明之感。
3月19日晚上，陈玉生又请武士英喝酒，还帮他买了新衣，并给了一笔钱。当日白天，武士英曾向隔壁房间的住客借了小洋三角。晚上饮酒回来后，武士英从怀里掏出一沓钞票炫耀道：“我现在已有钱。”随即取出一元钱，还给隔壁住客。住客道：“只借了三角钱给你，何必还这么多。”武士英得意洋洋地道：“待我事成，尚有千元。”语罢扬长而去。
3月20日晚上，陈玉生、武士英在半斋喝酒。酒吃得半醉，陈玉生道：“要办的这人姓宋，今晚就要上火车，今天就好行事了”，说完拿出一把勃朗宁手枪，交给武士英。这次刺杀，另外还有二人配合，帮忙叫了车，同到火车站，买了月台票三张。有一人不买票，在外面负责放风，此时已过深夜10时。
凶手武士英
票才买好，有一群人过来，往火车站贵宾区而去，陈玉生指着其中一人道：“就是这个姓宋的。”等了片刻，10时40分，姓宋的这群人从贵宾区出来，走到中途，武士英冲上去，对着他开了一枪，随后就往门口逃去。奔逃之间，地板滑溜，武士英失足跌倒，又胡乱开了两枪，爬起来跑到火车站门外。
武士英逃出后，叫了一辆黄包车，迅速赶到应夔丞家中。刚进门，陈玉生已经先到，对武士英云：“如今好了，我们已替四万万同胞除害了。”应夔丞随即做了安排，陈玉生先回镇江躲避，武士英暂住应家。早先交给武士英的手枪及所余三发子弹，也一起交给了应夔丞保管。
宋教仁的不归之旅
1913年3月中旬，袁世凯电邀宋教仁北上，希望他能调解南北关系。几天后，宋教仁收到一密信云：“北方忌先生者，欲杀之，务必戒备。”宋教仁看了后认为：“我平生对人既无私仇，也无夙怨，尽管与北方政治见解不同，他们也不会采用这种卑鄙手法。杀我只是谣言耳。”不加任何戒备。此后宋教仁多次接到告警，请重视安全，只当作谣言，泰然处之。
宋教仁定在3月20日晚11时，乘沪宁火车赴南京，转乘津浦火车北上。当晚6时，欧阳成等十四人，在一品香酒楼设宴，为宋教仁送行。饮至9时，宋教仁站起告辞，出一品香酒楼，奔赴车站。
10时30分，宋教仁一行乘马车抵沪宁火车站，前来送行的有黄兴等人，先在贵宾区（议员接待室）小憩。至10时40分，由吴颂华引路，宋教仁与黄兴、陈勤宣、廖仲恺、于右任、吴铁城、拓鲁生等人同行，向车站检票处行进。
行至检票处旁，突然宋教仁背后闪出一人，拿手枪开了一枪，子弹从宋教仁右后肋斜入腹部。刺客身躯短小，体形类似十五六岁的少年，身着黑色常服，开完第一枪后，迅速向外逃窜而去。因为车站石地板甚滑，仓促之中，刺客滑倒在地，在地上再放两枪，第二枪从黄兴身边掠过，第三枪从吴颂华胯下飞过，幸未伤人。刺客跃起，沿着铁护栏冲出车站，向东而逃，虽经巡捕追逐，却未能追到。
宋教仁先生中枪图
宋教仁中枪后，对于右任道：“我中枪矣。”于右任立刻借了汽车，亲自送宋教仁至沪宁铁路医院。待医生赶到医院后，立刻开始手术，至12时30分，始在右腰骨稍偏处取出子弹，子弹系勃朗宁手枪所用。手术后，医生判断，宋教仁存活概率只有1%，能否挽回，须待48小时后方可决定。
3月21日凌晨6时，医生过来详察，以吗啡针打入左臂，宋教仁渐渐沉睡。10时20分，宋教仁苏醒，痛感减少，只是屡屡呕吐。医生再次过来检查，黄兴、于右任等人请医生分析情况。医生分析后，告知于右任等人，须动手术才有生存希望，请从速决议。此时黄兴恰好出去，于右任与在场的众人商量之后，主张动手术者占据多数。
两名外籍医生又请了两名外籍医生，来医院相助。在下午两点半，将宋教仁移送到二楼手术室，只有于右任一人在旁陪同。医生将伤口处理，除去血块，又缝好创口。手术之后，因没有使用麻醉药，宋教仁频频呼痛，以吗啡针注射后，才缓解了痛楚。
3月21日夜12时，医生二人过来检查，判断宋教仁情况危险，已无可挽回。至22日凌晨3时，宋教仁已处于弥留之际，不能语言。黄兴靠近其面部，附耳呼曰：“钝初，你放心去吧。”时在旁多人，皆欲哭无泪。22日凌晨4时45分，宋教仁溘然长逝，年仅三十二岁。
宋教仁像
宋教仁有不世之才华，眼界深远，不存私欲，只图造就共和，进入文明富强国家。当其要一展身手之时，却被暗杀，这是中国近代史上最让人痛心的事。上海闸北宋教仁墓地，于右任撰书刻铭：“嗟嗟九泉之泪，天下之血，老友之笔，贼人之铁。勒之空山，期之良史，铭诸心肝，质诸天地。呜呼！”
3月24日，湖南人王阿法至四马路总巡捕房报告，应夔丞曾出示照片，请他杀了照片中此人。最近几日，王阿法看到各大报纸所印的宋教仁照片，与应夔丞出示的照片中人相似，特意来巡捕房报告。
巡捕房捕头根据王阿法的报告，当夜至法租界应夔丞住宅拘拿嫌犯。但应夔丞正在英租界妓院饮酒，又赶至英租界，于妓院内将应夔丞抓捕。在应夔丞家中也有收获，查获吴福铭（即武士英）等多人，并抄出共进会簿据与往来信札。
所抓获之人，被带回租界巡捕房，严加盘问。巡捕房找到一名在火车站见过凶手面貌的小孩，到场辨认，认出武士英即凶手。武士英被捕后供认不讳，并签字画押。巡捕房特意请镇江查访陈玉生，不久在镇江将陈玉生捕获，带回上海审讯。此后在应夔丞住宅中，搜出勃朗宁手枪一把，枪内尚存子弹三枚。经与火车站所开三枪的子弹对比，与宋教仁所中子弹相同。
宋教仁追悼大会
在应夔丞宅内搜出大量函电文件，其中有总理赵秉钧致洪述祖亲笔信两纸，致应夔丞亲笔信一封，以及赵送应密码电本一册，由此后世认为，赵秉钧是嫌疑人。实际上，应夔丞是江苏驻沪巡查长，负责“稽查匪情”，属于内务部（赵兼内务总长）管辖。去年12月，因为解散共进会一事，应夔丞入京，谒见总统、总理，至南归时，请求发给密码电本。赵秉钧唯恐他行事招摇，泄露消息，别生枝节，故而同意，嘱咐他有事电报直寄国务院。
应夔丞被捕后，送入总巡捕房收押。应夔丞毒瘾甚深，每日要吸鸦片五六元。牢房内不准吸毒，经过总巡同意，每日三顿饭食可在外购买，并准许购服戒烟丸，以抵烟瘾，算是享受了特殊待遇。
主谋人物洪述祖
宋教仁被刺案的应、武二要犯，随后被送到步兵第六十一团营地（即旧江苏海运局），由士兵严加看管。武士英每日饭量不佳。
4月23日夜半，武士英乘看管士兵换班之机，吞服毒物，至24号晨6时毒发，两鼻孔流血。武士英服毒后，红十字会外籍医生柯司赶来查验，发现武犯吞了火柴头的赤磷，很快毙命。
5月中旬，宋案要犯应夔丞，被交给上海地方检察厅模范监狱看押。移解到模范监狱后，应夔丞又索取鸦片，狱方告以狱中管理严格，不许吸食鸦片，但同意他每日服戒烟药丸抵毒瘾。
此年7月，“二次革命”爆发时，大烟鬼应夔丞正被关在模范狱中。7月24日深夜，应夔丞等要犯，用铁斧巨石，猛砸监狱围墙，凿出四洞，从洞中一拥而出，逃出男女各犯约二百人，在附近屋檐下敲去镣铐，各自逃逸。看守兵士见此等亡命之徒逃出，也不拦阻，虽然开枪射击，却未伤及一人。
应夔丞越狱后，前往北京，要求袁世凯给予赏赐，袁世凯拒绝接见。1914年1月20日下午，应夔丞搭火车，乘头等座前往天津，途中被军法侦探长郝占一用刀刺死。此年6月20日，执法处总办事陆建章调任陕西都督，郝占一随同前往，等候任用，也被杀掉灭口。
此案的主谋洪述祖是江苏武进人，其人被认为是“小有才之邪人”。青年时代，洪述祖就好作大言，行事放荡。他曾至台湾，在刘铭传身边效力七八年。光绪十四年，台湾商务局在美国订购了两艘快船，由洪述祖前去接收，不想他侵吞公款，入狱三年，由此可见其人一斑。
洪述祖像
出狱后洪述祖依然活跃，结交各路达官贵人，一度总理《求是报》。一说他曾以万金行贿李鸿章，开复原官，此后到武汉任官两年，时常出入烟花柳巷，号称“嫖界大王”。在湖北混得并不如意，洪述祖又协助李经方（李鸿章长子），到安徽督办全省铁路。随着李经方转任驻英公使，退出安徽铁路公司，洪述祖也回到上海。宣统元年，洪述祖一番运作，得以总办井陉矿务局，经手对外借款，捞了一大笔回扣，被弹劾去职。此后洪述祖在天津，家中一群小妾，过着声色犬马的奢侈生活。
辛亥革命爆发后，洪述祖为袁世凯出谋划策，在清廷与革命军之间玩弄两面手法，得到袁世凯赏识。北洋政府成立后，在唐绍仪推荐下，洪述祖任内务部秘书。洪述祖任内务部秘书时，经人介绍，与应夔丞相识，将其收编，二人函电往来密切。
1913年，洪述祖出面联络应夔丞，刺杀宋教仁。
之所以要杀宋，因为此前为了解散共进会，洪述祖联合应夔丞，从袁世凯手上骗了五万元。此后二人又以构陷“孙黄宋”为名，想再从袁世凯这里骗一笔钱，目标是三十万。不想袁世凯这次警觉了，认为洪述祖、应夔丞只放空炮，不办实事。洪述祖、应夔丞没法向袁世凯交代，又怕追究，就擅作主张，干一票大的，刺杀宋教仁交差。
洪述祖催应夔丞“密事速进行”的电文
宋教仁案发后，洪述祖提前逃到青岛租界躲避。过了几年，他以为风头过去，化名张皎厂（即张教安）回到上海租界。1917年4月，宋教仁15岁的儿子宋振吕与秘书得到消息，向上海检察厅控诉。检察厅向会审公廨交涉引渡，后将洪述祖押解北京。1919年3月，判处洪述祖死刑，4月初被绞毙。
结语
一说认为，武士英受应夔丞指使，应夔丞受内务部秘书洪述祖指使，洪述祖是总理（兼内务总长）赵秉钧的下属，进而又认为总统袁世凯脱不开关系。但赵秉钧与宋教仁私交甚好，与洪述祖的往来书信及密电，也不涉及刺宋，与此案并无关系。至于后世所云赵秉钧被袁世凯下毒，吐血而死，也非真相。赵秉钧之子赵纯佑云：“其实他是死于中风，即今所谓脑溢血，倒卧于内寝室床头侧旁，这是当时家属亲见，并无吐血情形。”
宋教仁身亡当日，袁世凯得知后，长叹云：“国民党失去了宋教仁，少了一个大主脑，以后越难说话。”国民党代表谒见袁世凯时，袁谓：“正式政府本赖宋氏为巨擘，今竟失之，实梦想不到也。”言毕大哭。如北京大学尚小明教授所云，袁世凯对宋教仁，既有不满，又有期待，对其被害又感到惋惜的复杂内心，可以说最符合历史实情。
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