当前，开展植物分子生物学研究工作，早已不是独立看待某一个基因，绝大多数时候，我们是以「基因家族」的角度来看到我们的研究工作，尽管往往只关注其中特定一个成员，或者其中特定分支。当然，还有很多时候，我们是多物种地分析某个基因所在的同源基因演化树分支特点。
很多时候，我们构建的是进化树，要知道，绝大多数进化树构建软件，构建的本质上是无根树，但是很多人，都用有根树的方式进行可视化和分析。其中对错与否，之前TBtools的「Simple Tree View」功能介绍时，已经与大伙分享。TBtools 也提供了 MidPoint 和 MAD 算法的具体实现，用于进化树定根。
但很多时候面，基因树的分析，我觉得用无根树会更合理一些。因为输入数据本身常常并没有真正意义的外类群。没有外类群，则所有置根的算法都是有人为假定的，多数时候OK，不代表永远OK。
无根树不做这个假定，但TBtools之前是没有无根树可视化的。很多时候，我推荐大伙用 FigTree。然而，FigTree 作者非常佛系，他本身就没打算开发好 FigTree，只是一个副产品。FigTree 并没有多特别的功能，但一个字“他就是好用！”，非常容易掌握和使用。其依赖于环境中的Java，用起来就麻烦。更多时候已有版本不支持JDK的不同版本。
好了，总而言之，软件虽好，打开软件反而是个问题。我想着，为什么TBtools里面不写一个？于是，现在就有了 TBtools 的 无根树 可视化功能。使用非常简单。
点击之后弹开
随后可以直接点击「加载Newick文件」或者我喜欢的「拖拽置入」进化树文件即可。
调整各类参数
至于怎么保存图片？那就是 JIGplot 的常见操作，「Ctrl+S」或者Mac的「Command+S」