摘要
系统发育末端定年法（Phylogenetic tip-dating）正在并持续以多种方式革新演化生物学。化石末端定年法将化石作为末端类群，基于形态和/或分子特征信息置于系统发育树中，与节点定年法（node-dating）相比，为推断时间标定的系统发育树提供了一种更为严谨的方法。此外，包含化石作为末端类群的系统发育树在宏观演化研究中，例如解析多样化模式和表型定向演化，正变得越来越重要。自2011年首次演示以来，化石末端定年法在实证应用中正逐步获得关注，并在统计模型、软件和数据集方面取得了长足进步。然而，执行一项系统发育化石末端定年分析是复杂的，并面临诸多挑战。在此，我们针对包含化石的系统发育末端定年分析的方法与模型，提供一篇详尽的综述与概览。我们同时关注数据收集与准备以及模型选择。我们首先对迄今为止所有已发表的系统发育末端定年研究进行了调查，展示了常见的数据和模型选择以及新方法的趋势。然后，我们引导读者依次了解分子演化、形态演化（包括离散和连续数据）以及世系演化（化石化出生-死亡过程）等部分。在每一部分中，我们描述了数据和标准模型及其基本假设，并提供了展望和实用建议。
Cite
Nicola S Heckeberg, Alessio Capobianco, Basanta Khakurel, Gustavo Darlim, Sebastian Höhna, Practical Guide and Review of Fossil Tip-Dating in Phylogenetics, Systematic Biology, 2025;, syaf050, https:///10.1093/sysbio/syaf050