导语

Sci Rep | miR-1290 在癫痫胶质母细胞瘤患者中的显著性
结果:
GBM 相关癫痫的临床特征
本研究纳入了 173 名接受胶质母细胞瘤(GBM)初次切除的患者。其中 44 人(25.4%)有术前癫痫发作,129 人(74.6%)无癫痫病史。术前癫痫患者的存活时间显著长于无癫痫患者(图)。1)。
173 例 GBM 病例中,癫痫组与非癫痫组存活率有显著差异。(A)术前癫痫患者表现出较长的无进展生存期,与无术前癫痫患者相比。(B)术前癫痫患者整体生存期较无术前癫痫患者更长。
患者特征
手术期间患者的平均年龄为 48.3 岁,年龄范围从 17 岁到 72 岁不等。男性胶质母细胞瘤(GBM)患者术前癫痫发作的概率显著增加(p = 0.024)。关于癫痫发作类型,近一半患者(47.7%)发生全身性癫痫发作,52.3%发生局灶性癫痫发作。表 2 全面列出 了导致患者术前癫痫发作的诱因。
差异表达的 MiRNA 及其在癫痫中的影响
对 81 个样本进行了全基因组 miRNA 分析,以识别有无术前癫痫患者间表达差异的 miRNA。在这些患者中,有 7 种 miRNA 在术前癫痫患者中明显表达不足(p3C 0.05 且至少 1.5 倍变化,见表 3)。值得注意的是,miR-1290 表现出最高的褶皱变化(> 2 折叠)。鉴于其显著的差异表达,miR-1290 被选中进行进一步研究。随后,作者使用一个独立队列的 92 个样本来验证 miR-1290 表达与术前癫痫发生之间的关联。如图 2 所示,术前癫痫患者的 miR-1290 水平低于无癫痫患者(p = 0.018)。
qPCR 表达 miR-1290 与验证队列中 GBM 患者术前癫痫发作的关联。红色区域代表癫痫组,绿色区域代表非癫痫组,癫痫组中 miR-1290 的表达低于非癫痫组。
miR-1290 的生物学见解
为阐明 miR-1290 的生物学意义,作者分析了 56 名 mRNA 阵列数据交集患者的基因表达模式。利用 miR-1290 预测的前 100 基因特征,作者观察到根据癫痫症状显著聚集的基因(见图)。3)。
基因聚类基于癫痫症状,利用 miR-1290 预测的前 100 个基因特征。
为了进一步探讨 miR-1290 在 GBM 中的潜在作用,作者进行了进攻分析。miR-1290 最相关的基因,即细胞簇的特征基因列表。官方基因符号被选为标识符,智人被选为物种。最后,基因本体论(GO)分析(见图)。4)以及《京都基因与基因组百科全书》(KEGG)(图。5)获得通路分析富集结果。本研究展示了 P 值(P < 0.05)从高到低的前五结果。从结果中,作者发现与 miR-1290 最相关的生物过程包括 RNA 聚合酶 II 对转录的调控、DNA 模板转录的调控,以及 RNA 聚合酶 II 对转录的正向调控。此外,miR-1290 最相关的细胞成分是细胞核。分子功能包括 RNA 聚合酶 II 顺式调控区序列特异性 DNA 结合。
利用 miR-1290 靶基因进行的去氧酶分析结果。miR-1290 与胶质母细胞瘤中的转录调控密切相关。生物过程(BP)、细胞组分(CC)和分子功能主要与 miR-1290 相关。与 miR-1290 最相关的生物过程包括 RNA 聚合酶 II 对转录的调控、DNA 模板转录的调控,以及 RNA 聚合酶 II 对转录的正向调控。此外,miR-1290 最相关的细胞成分是细胞核。分子功能包括 RNA 聚合酶 II、顺式调控区序列特异性 DNA 结合。
利用 miR-1290 靶基因进行 KEGG 分析结果。miR-1290 与紧密连接的功能最为相关。
miR-1290 与存活率的关系
在作者的研究中,miR-1290 是唯一与患者存活相关的 miRNA。生存分析(如 Kaplan-Meier 生存曲线和 Cox 回归分析)显示,miR-1290 的表达水平显著影响患者生存时间。与其他六种 miRNA(截止百分位为 50%)相比,miR-1290 表现出明显的生存预后效应(见图)。具体来说,高表达组的 miR-1290 存活率与低表达组显著不同,表明 miR-1290 在胶质瘤的生物过程中起着重要作用。
miR-1290 的存活图(0.5 百分位)。红色代表高表达组,绿色代表低表达组,低表达组存活时间长于高表达组。

总结

作者的研究提供了开创性的证据,证明 miR-1290 作为预测 GBM 患者癫痫易感性和总体生存期的新颖且有价值的生物标志物。有必要进行前瞻性对照研究以严格验证这些发现。对 miR-1290 靶基因及其下游通路的进一步研究,将有助于通过涉及癫痫发生和肿瘤进展的分子机制,识别出能够改善 GBM 患者的预后的药物靶点 。