氟是一种具有独特性质的神奇元素,比如原子半径小、电负性最强,还具有亲脂性。此外,氟也是氢键受体。因此,将氟原子或含氟基团引入生物活性化合物中,往往会使其生物和理化性质发生显著变化,包括溶解度、pKa、亲脂性、构象、代谢稳定性和膜通透性,进而有助于改善药代动力学特征。

含氮药物分子普遍存在,在生命科学中起着关键作用。如今,已知超 50% 的药物含有氮元素。本文主要分享截止2023年已上市的药物中,具有含氮连接的含氟结构单元的药物的合成路线:

夸西泮(P-1)为苯二氮䓬类催眠药,作为 γ-氨基丁酸 A 型(GABAA)受体激动剂,与特定的结合位点结合,以增强 γ-氨基丁酸(GABA)对GABA 受体的亲和力,从而产生多种药理活性,如镇静、催眠、抗焦虑、抗惊厥和中枢性肌肉松弛作用。三氟乙基的引入提高了其抗脱烷基化能力,从而增强了代谢稳定性。

夸西泮通过经典合成路线合成,选择 2,2,2-三氟乙基三氯甲烷磺酸酯(8-2)对氯苯胺(8-1)反应,得到烷基化苯胺 8-3 ,经过氮丙啶环的亲核开环,形成胺 8-4, 与苯甲酰氯 8-5缩合,生成酰胺 8-6,随后通过用 P₂O₅和 POCl₃处理进行环化,以 75% 的产率得到苯二氮䓬 8-7,用 RuO₄氧化得到苯二氮䓬 8-8,最后与 P₂S₅在二恶烷中反应,得到夸西泮。

哈拉西泮(P-2)也属于苯二氮䓬类催眠药,与夸西泮具有相似的药理作用机制。

从苯胺 8-9 开始,使用与夸西泮相似的合成方法,可以实现了哈拉西泮的快速合成

氟罗沙星(P-3)是细菌 DNA 促旋酶的抑制剂,具有广泛的抗菌谱。它是由协和发酵麒麟株式会社开发的第三代氟喹诺酮类抗生素,已获得日本、美国、中国和瑞士批准上市。

2,3,4-三氟苯胺与二乙基(乙氧亚甲基)丙二酸酯(EMME,8-14)在 130℃下反应,随后于 300℃发生环化,生成氟喹诺酮 8-15 ,随后进行 N-氟乙基化得到 8-17 ,与 N-甲基哌啶通过亲核取代反应进行偶联,再用盐酸水解,完成氟罗沙星的制备。

氟托溴铵(P-4)是一种新型的乙酰胆碱受体竞争性拮抗剂,由罗塔法姆・马丹斯(Rotapharm Madans)开发作为抗痉挛药,对毒蕈碱型神经末梢 M1、M2 和 M3 受体表现出良好的拮抗活性。它于 1990 年首次获得德国当局批准,用于治疗尿失禁。

以二苯羟乙酸 8-20 为起始原料,用 N,N’-羰基二咪唑(CDI)活化 8-20 ,随后与去甲莨菪碱 8-23 进行酯化反应,得到酯 8-24 。在 PPh₃存在下,于 300W 灯照射下将 8-24 暴露于 O₂中 10 小时实现脱甲基化,得到托烷酯 8-25 ,经 N-氟乙基化,然后用 MeBr 季铵化,制备得到氟托溴铵

马拉维若(P-5)是 CC 趋化因子受体 5(CCR5)趋化因子受体的一种特异性、缓慢可逆的非竞争性拮抗剂,由辉瑞公司(Pfizer)于 2007 年开发为新型 HIV-1 治疗药物,针对病毒循环感染的早期步骤,因为该趋化因子受体对于 HIV-1 进入宿主细胞至关重要。马拉维若已获得美国 FDA 和欧盟批准,用于治疗 HIV 感染患者,包括仅感染 CCR5 嗜性 HIV-1 病毒的患者,以及感染对多种抗逆转录病毒药物耐药的 HIV-1 毒株的患者。

用 DAST 对羧酸盐 8-27 进行偕二氟化,随后经另外两步反应得到氟化酰氯 8-30 。然后通过酶法拆分路线得到对映体(S)-β – 氨基酯 8-31 ,将其与 8-30 偶联形成酰胺酯 8-32 。还原及后续氧化反应得到醛 8-34 ,与三唑中间体 8-35 之间的还原胺化反应完成了马拉维若的合成。

西他沙星是一种广谱口服氟喹诺酮类药物,对多种革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌具有很强的活性,包括厌氧菌,以及对非典型病原体也有活性。它于2008 年在日本首次获批,用于治疗多种细菌感染,例如咽喉咽炎、扁桃体炎、急性支气管炎、肺炎、慢性呼吸道疾病的继发性感染、膀胱炎、肾盂肾炎、尿道炎、宫颈炎、中耳炎、鼻窦炎、牙周炎、腹膜炎和颌骨骨髓炎。

以 3-(3-氯-2,4,5-三氟苯基)-3-氧代丙酸酯(8-41)为起始原料, 与原甲酸三乙酯在无水乙酸酐中反应,随后与 8-40 进行偶联,得到化合物 8-42。在氢化钠(NaH)存在下环化 8-42,得到氟喹诺酮 8-43,水解后形成 8-44。最后,8-44 与 (S)-N – 叔丁氧羰基-5-氮杂螺 [2.4] 庚-7-胺(8-45)发生芳香亲核取代反应,随后脱除叔丁氧羰基(Boc),完成西他沙星的合成。

22种含氮、氟小分子药物的合成路线总结

伐鲁比星(P-7)由安托制药公司(Anthra Pharmaceuticals)研发,它可作为拓扑异构酶 Ⅱ 和 RNA 合成的抑制剂,在动物体内的心脏毒性显著更低。2009 年FDA批准用于治疗膀胱难治性原位癌(CIS)。

以柔红霉素(8-47)的溴化反应为开端,在原甲酸三乙酯存在下,用 Br₂进行反应,生成 8-48。随后与戊酸钠发生亲核取代反应,得到中间体 8-49,进行脱乙酰基反应,然后用三氟乙酸酐进行 N-三氟乙酰化反应,完成伐鲁比星的合成。

碘 [¹²³I] 氟潘(P-8),能够快速且高亲和力地与多巴胺转运体结合,还能抵抗酶促水解,它于 2011 年被FDA批准,用于人脑组织中细胞膜多巴胺转运体的单光子发射计算机断层扫描(SPECT)成像。

通过对前体 3β-(4-Me₃Sn-苯基) 托烷 8-57 进行碘代锡烷基化反应合成,反应中使用 Na [¹²³I],并在过氧乙酸(CH₃CO₃H)存在下,于 pH 3-4 条件进行,之后用 Novapal C-18 柱通过高效液相色谱(HPLC)纯化。3β-(4-Me₃Sn-苯基) 托烷 8-57 由 8-56 经 Pd (0) 催化、用六甲基二锡进行锡烷基化反应制得 。

洛美他派(P-9)是一种微粒体甘油三酯转运蛋白(MTP)抑制剂,由埃杰里翁制药公司(Aegerion Pharmaceuticals)研发的小分子药物,于 2012 年获美国食品药品监督管理局(USFDA)批准,用于治疗家族性和原发性高胆固醇血症。

以8-58 为起始物料,经烷基化反应生成 9-羧基芴8-59,再经SOCl₂和 CF₃CH₂NH₂・HCl 处理,转化为 N-CH₂CF₃酰胺 8-60 。用哌啶 8-61 进行亲核取代并随后脱除 Boc 保护基,得到中间体 8-62 。最后,与苯甲酰氯 8-63 偶联,接着进行成盐反应,制得洛美他派甲磺酸盐 。
氟雷拉纳(P-10)是昆虫配体门控氯离子通道抑制剂,尤其能抑制 γ-氨基丁酸(GABA)门控氯离子通道,属于异恶唑啉类,具有三氟甲氧基乙胺这一关键结构特征,可用作动物驱虫剂,由日东化学工业株式会社公司研发。

3,5-二氯 -2,2,2 -三氟苯乙酮(8-64)与乙酰丙酮在催化量碳酸钠存在下反应,生成中间体醇 8-66。随后脱水,并在 NH₂OH・HCl 作用下环化,得到关键的异恶唑啉中间体 8-68。同时8-69 与 CF₃CH₂NH₂・HCl 经酰胺化反应生成化合物 8-70,该化合物经肼解反应生成 1-氨基 -(2,2,2-三氟乙基) 乙酰胺(8-71)。最终,异恶唑啉 8-68 与 8-71 经缩合反应,以 73% 的收率合成氟雷拉纳

阿福拉纳(P-11)与弗雷拉纳类似,由勃林格殷格翰公司研发。

4-乙酰-1-萘羧酸(8-72)用 SOCl₂处理,得到酰氯 8-73,该酰氯与 8-71 偶联得到 8-74。接着,8-74 与 8-75 缩合,得到高级中间体 8-76。异恶唑啉形成反应随后完成阿福拉纳的合成。

洛替拉纳(P-12)与氟拉兰纳、阿福拉纳类似, 这三种药物均属于异恶唑啉类,由诺华公司研发。
以 8-77与噻吩 8-78 偶联为起始步骤,接着进行对映选择性异恶唑啉形成反应和羧基化反应,生成中间体 8-81,收率适中,对映体过量(ee)为 98%。最后一步酰胺化反应制得洛替拉纳。
艾伏西尼布(P-13)是同类首创的口服突变型胞质异柠檬酸脱氢酶 1(IDH1)抑制剂,由 Agios 制药公司研发。2018 年FDA批准用于治疗携带易感 IDH1 突变的复发或难治性急性髓系白血病(AML)成年患者。

通过用 DAST 对N-Boc-3-氧代环丁基胺(8-82)进行偕二氟化反应,制备 N-(3,3-二氟环丁基) 甲酰胺(8-83)。随后脱保护,用 SOCl₂处理得到异腈 8-84,接着在三氟乙酸(TFA)存在下,与亚胺 8-85 和酸8-86 进行关键的乌吉(Ugi)反应,得到混合物形式的粗品 8-87。通过酸/碱萃取、哌啶处理以及从乙酸甲酯/叔丁基甲基醚(MTBE)中结晶,以 40% 的收率分离出光学纯的异构体8-88,最后与 2-氯异烟腈(8-89)经 Buchwald-Hartwig 交叉偶联反应,制得艾伏西尼布。

盐酸洛美沙星(P-14)是一种新型 8-甲氧基氟喹诺酮类抗菌剂,由协和发酵麒麟株式会社研发。2019 年,它在日本获得上市批准,用于治疗呼吸道以及耳、鼻、喉感染,包括社区获得性肺炎和耳鼻咽喉科感染。
合成以 β-酮酯 8-90 与原甲酸三乙酯的缩合反应为开端,生成 8-91 。用 2-氟乙胺盐酸盐处理 8-91,随后进行环化反应,得到氟喹诺酮 8-92 。接着乙酯通过与硼酸和乙酸酐反应,转化为硼酸络合物 8-93 ,最后与8-84反应制备得到盐酸洛美沙星。
乌帕替尼(P-15)是每日一次口服给药的选择性 Janus 激酶 1(JAK1)抑制剂,由艾伯维(AbbVie)研发。2019 年 8 月,其获美国批准用于治疗中重度活动性类风湿关节炎,以及对甲氨蝶呤应答不足或不耐受的情况 。
采用Cbz 保护的甘氨酸乙酯 8-95 与丙烯酸乙酯 8-96 在 t-BuONa 存在下发生原位迈克尔加成-迪克曼缩合,得到 β-酮酯 8-97,收率 80% 。用 TsCl 处理 8-97 生成烯醇对甲苯磺酸酯 8-98 。接着经铁催化交叉偶联(8-98 与 EtMgBr)和酯水解(LiOH),从 8-97 经三步以 43% 收率得到二氢吡咯酸 8-99 。在 580 psi H₂ 、以 Ru (OAc)₂ (S – SEGPHOS)(0.1 mol%)为催化剂,对 8-99 进行不对称氢化得到手性吡咯烷酸 8-100。经缩合得到吡咯烷 8-101,再与吡咯并吡嗪 8-102 反应,偶联产物后续环化形成咪唑环,最后通过三氟脲的后期构建完成乌帕替尼。
乌布洛帕坦(P-16)是艾尔建(Allergan)授权给默克(Merck & Co)研发的首款口服降钙素基因相关肽(CGRP)受体拮抗剂。2019 年 12 月,其在美国首次获批用于成人偏头痛(有或无先兆)的急性治疗 。
通过对溴苯乙酸 8-106 与丙烯酸 8-105 加成、后续用 Pd/C 脱溴、再环化制备得到内酰胺8-108。用 CF₃CH₂OTf 作为氟烷基试剂、t-BuOLi 作为碱对 8-108 进行 N – 2,2,2-三氟乙基化,接着脱 Boc 保护基得到 CF₃CH₂保护的吡啶酮 8-109。通过结晶诱导的非对映选择性转化(CIDT),在 1mol% 3,5-二氯水杨醛存在下用对甲苯酸处理,实现 C-3 中心立体化学构建,对甲苯酸盐 8-110 收率 86% 、ee 值 99.6% 。8-110 经解离后与羧酸 8-114 反应,以 95% 收率得到乌布洛帕坦。
阿泰哌(P-17)是首款口服可用的降钙素基因相关肽(CGRP)受体拮抗剂,由艾伯维(AbbVie)研发,2021 年获美国 FDA 批准用于成人偏头痛的预防性治疗 。
用 t-BuOLi 和 ZnBr₂处理酮 8-116 转化为烯醇中间体,再与甲磺酸酯 8-115 反应,得到氨基酸衍生物 8-117 。用转氨酶进行酶促还原胺化,接着环化,得到内酰胺 8-118 ,再转化为 N-三氟乙基内酰胺盐 8-119,在 2-甲基四氢呋喃(2-MeTHF)中用 t-BuOK 处理,经三步反应(选择性 N-三氟乙基化、脱 BocNH 保护基、与氨基酸成盐) 得到盐 8-119, 用 5% K₃PO₄水溶液中和,接着在 N-(3-二甲氨基丙基) -N’-乙基碳二亚胺(EDCI)存在下与羧酸 8-114 反应,以 95% 收率得到阿泰哌。
尼马瑞韦(P-18)是 2021 年获美国 FDA 批准的新化学实体(NCE),是辉瑞(Pfizer)新冠口服药帕罗维德(Paxlovid)的活性成分,用于治疗 COVID-19 。

氨基酸 8-120 在甲醇中、以 NaOMe 为碱,与三氟乙酸乙酯反应得到 8-121 。同时,脯氨酸甲酯盐酸盐 8-123 经 TEA 和 NaOH 依次处理得到双环脯氨酸钠盐 8- 122 。在丙基膦酸酐(T3P)和 DIPEA 存在下,8-121 与 8-123 偶联,得到八肽双环脯氨酸酸 8-124 。N-Boc 氨基酸甲酯 8-125 用氨甲醇溶液处理,以 98% 收率得到伯酰胺 8-126,在无水 2-MeTHF 中、NMM 存在下,用 TFAA 处理脱水,得到胺盐酸盐 8-127 。最后,在 EtOAc 中、0℃ 至室温条件下,双环脯氨酸酸 8-124 与胺 8-127 在T3P 和 DIPEA 存在下反应得到尼马瑞韦 。

阿达格拉西布(P-19)由 Mirati Therapeutics 研发,已知可靶向突变 KRAS G12C 蛋白的半胱氨酸,作为 KRAS G12C 口服、不可逆共价抑制剂,2022 年获美国 FDA 批准,用于治疗携带 KRAS G12C 突变的局部晚期或转移性非小细胞肺癌成人患者 。

哌嗪 8-129 与二氯嘧啶 8-130 发生区域选择性反应,得到 8-131 。接着,通过 Pd 催化 C-O 键形成反应将吡咯烷 8-132 引入 8-131 。所得产物经脱 Boc 保护、后续酒石酸酰化,以 80% 收率得到 8-133 。然后,8-133 用 K₂CO₃转化为游离氮碱,与萘基溴 8-134 经 Buchwald – Hartwig 反应偶联。所得产物经结晶得到甲苯磺酸盐得到 8-135 。最后,通过新型亲核脱保护反应移除 Cbz 基团,得到阿达格拉西布 。
来那卡帕韦(P-20)是同类首创的 HIV 衣壳抑制剂,用于治疗极具耐药性的 HIV 感染。它由吉利德科学公司(Gilead Sciences)研发,已知可通过与 HIV 衣壳蛋白的两个相邻亚基结合,干扰 HIV 生命周期的多个阶段 。
化合物 8-137 与(S)-甲基-2-磺酰胺 8-138 缩合,得到亚胺 8-139,亚胺 8-139 与 3,5-二氟苄基锌 8-140 发生亲核加成反应,得到胺 8-141。 随后转化为 Boc 保护的 8-142,与炔烃 8-143 发生 Sonogashira 交叉偶联反应,得到高级中间体 8- 144 。氨基吡唑 8-145 在 Cs₂CO₃存在下,于 DMF/H₂O 中用 1,1,1 – 三氟乙基三氟甲磺酸酯处理,得到三氟乙基取代的吡唑 8-46 。此外,硼酸酯 8-147 通过 B₂pin₂与 8-146 在 Pd (PPh₃)₂Cl₂/KOAc 催化下、于 DMF 和二恶烷混合溶剂中反应制得。接下来,8-144 与硼酸酯 8-147 进行 Suzuki 交叉偶联反应,生成高级中间体 8- 148 ,用 MsCl 处理,接着用 TFA 脱除 Boc 基团,得到 8-149 。以双环 [3.1.0] 己 -3-酮 8-150 为起始原料,经七步反应实现羧酸中间体 8-154 的大规模合成 。最后,在 HATU 介导下,手性胺 8-149 与羧酸 8-154 在 DMF 和 DIPEA 中偶联形成酰胺,随后选择性裂解一个 Ms 基团,得到来那卡帕韦 。
匹妥布替尼(P-21)由礼来公司(Eli Lilly)研发,是一种高度选择性、非共价、可逆的布鲁顿酪氨酸激酶(BTK)抑制剂,2023 年,美国 FDA 根据加速批准途径,批准其用于治疗接受过至少两种系统治疗(包括一种 BTK 抑制剂)后复发或难治性的成人套细胞淋巴瘤(MCL)患者 。
苯甲酸 8-155 用 SOCl₂处理转化为苯甲酰氯,接着与 8-156)反应,生成苯甲酸 8-157,用 SOCl₂转化为酰氯,随后与丙二酸二乙酯反应,生成芳基烯醇中间体8 -158 。用 CH (OMe)₃对芳基烯醇进行甲基化,得到芳基烯醚 8-159, 与 1,1,1-三氟丙基肼环化,生成三氟取代的吡唑,随后完成匹妥布替尼的合成。

奥马韦洛酮(P-22)由 Reata Pharmaceuticals 公司研发,是一种口服活性的小分子半合成三萜类药物,可提高抗氧化活性 。2023 年 2 月,美国 FDA 批准奥马韦洛酮用于治疗 16 岁及以上的弗里德赖希共济失调(Friedreich’s ataxia)成人和青少年患者 。

以齐墩果酸(8-160)为起始原料,经多步转化制备得到中间体 8-164 ,用二苯基磷酰叠氮(DPPA)处理,形成酰叠氮 8-165 。随后发生 Curtius 重排,得到胺 8-166 ,与 CH₃CF₂COOH 和 DCC 在催化量 DMAP 存在下进行酰胺化反应,完成奥马韦洛酮的制备。

参考文献:Chem. Rev. 2025, 125, 4603−4764